Xinglong

Xinglong

Η αλληλούχηση σε επίπεδο μεμονωμένου κυττάρου (single-cell sequencing) είναι μια τεχνολογία που επιτρέπει την ανάλυση του γονιδιώματος ή του μεταγραφώματος ξεχωριστών κυττάρων παρέχοντας υψηλής ανάλυσης δεδομένα για τη μοριακή τους κατάσταση. Σε αντίθεση με τη μαζική αλληλούχηση (bulk sequencing), στην οποία εξετάζεται το μέσο σήμα από έναν πληθυσμό κυττάρων, η single-cell προσέγγιση αναδεικνύει την ετερογένεια που εμφανίζεται μεταξύ διαφορετικών κυττάρων του ίδιου ιστού ενός οργανισμού. Η τεχνική αυτή προσδίδει την ικανότητα αναγνώρισης σπάνιων κυτταρικών τύπων, τη μελέτη μεταβατικών φάσεων κατά τη διαφοροποίηση των κυττάρων, αλλά και την κατανόηση μηχανισμών σε πολύπλοκα βιολογικά συστήματα. Εικόνα 1. Επισκόπηση των διαδικασιών της single-cell RNA sequencing. Οι πρώτες επιτυχημένες εφαρμογές single-cell transcriptomics εμφανίστηκαν το 2010 με το εργο των Tang et al. να θεωρείται ορόσημο για την πλήρη αλληλούχηση μεταγραφώματος από μεμονωμένα κύτταρα. Αρχικά, οι μέθοδοι ήταν περιορισμένες σε αριθμό κυττάρων και ο βαθμός ευαισθησίας ήταν αρκετά χαμηλός· με την πρόοδο των τεχνολογιών αλληλούχησης νέας γενιάς, NGS έγινε δυνατή η ανάλυση πολυάριθμων κυττάρων ταυτόχρονα. Γενικά, η single-cell αλληλούχηση έχει…