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组织蛋白酶S(英文:Cathepsin S)是人类体内由CTSS基因编码的蛋白质。该基因存在利用多腺苷酸化信号的转录变体。 组织蛋白酶S是木瓜样蛋白酶肽酶C1家族的成员。它是一种溶酶体半胱氨酸蛋白酶,可参与将抗原蛋白降解为肽以呈递给MHC II类分子。组织蛋白酶S可以在肺泡巨噬细胞的广泛的pH值范围内作为弹性蛋白酶发挥作用。

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